27

 0    184 fiche    chomikmimi
laste ned mp3 Skriv ut spille sjekk deg selv
 
spørsmålet język polski svaret język polski
Genom człowieka to
begynn å lære
mat. genetyczny zawarty w haploidalnym zestawie chromosomow (n=23)
Na genom czlowieka składają się
begynn å lære
1) DNA w jądrze, dna genomowe (gDNA) oraz 2) DNA mitochondrialny (mt DNA)
gDNA zawiera
begynn å lære
3,08 miliardów nukleotydów
Eksony stanowią
begynn å lære
1,5% dna
Introny stanowia
begynn å lære
25,5 % Dna
DNA niekodujący stanwoi
begynn å lære
73% dna
mtDNA występuje
begynn å lære
w postaci kolistych cząsteczek w macierzy mitochondriów
Dzięki technikom klonowania staje się możliwe
begynn å lære
uzyskiwanie dużych ilosci materialu do badan sekwencyjnych
Enzymy restrekcyjne tworzą
begynn å lære
system obronny bakterii i sinic przed infekcją z udziałem wirusów bakteryjnych i bakteriofagów
Enzymy restrykcyjne tnące DNA w miejscu specyficznych sekwencji, dł.
begynn å lære
Długość zależy od odległości między sekwencjami rozpoznawanymi przez enzym
Identyfikacja miejsc rozpoznawanych przez różne enzymy restrykcyjne pozwala na
begynn å lære
skonstruowanie mapy restrykcyjnej
Nazwy enzymów tworzy się
begynn å lære
od 1 litery nazwy rodzajowej i 2 liter nazwy gatunkowej
1 jednostka enzymu restrykcyjnego oznacza
begynn å lære
taka jego ilosc, ktora katalizuje kompletną hydrolizę wiązan w cz. fazowego dna u masie 1ug(50kpz) w ciagu 1 godz i w temp. 37 stopni
Rozpoznawana sekwencja: ecori
begynn å lære
5' g/aattc 3', 5' jest lepkim koncem
Rozpoznawana sekwencja: Hae III
begynn å lære
5' GG/CC 3', powstaja tepe konce
Rozpoznawana sekwencja: HhaI
begynn å lære
5' GCG/C 3', 3' jest lepkim koncem
ECORV Rozpoznawana sekwencja:
begynn å lære
5' GAT/ATC 3', powstają tepe konce
Rozpoznawana sekwencja: taqI
begynn å lære
5' t/cga 3', 5' jest lepkim końcem
Rozpoznawana sekwencja: NotI
begynn å lære
5' gc/ggccgc 3', enzym rozpoznający 8-nukleotydową sekwencję
Lepkie końce 3' tworzone przez enzymy restrykcyjne
begynn å lære
złożone z 2-4 nukleotydów
Lepkie końce 5' tworzone przez enzymy restrykcyjne
begynn å lære
złożone z 2-6 nukleotydów
Izoschizomery
begynn å lære
Enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Lepkie końce
begynn å lære
1niciowe sekwencje wystepuja na obu koncach czasteczki przeciete niesymetryczne
Fragmenty DNA powstałe po trawieniu restryktazami można
begynn å lære
rozdzielac elektroforetycznie
Po elektroforezie, jaki rozklad dna?
begynn å lære
liniowy rozklad otrzymanych fragmentow od najmniejszych do najwiekszych
Na tej samej wysokosci zelu znajduja się
begynn å lære
fragmenty identycznej wielkości, co zwykle odpowiada takiej samej sekwencji nukleotydowej
Mapa restrykcyjna
begynn å lære
wzajemne ułożenie miejsc
wzór restrykcyjny
begynn å lære
tworzony przez wielkosc fragmentow otrzymanych po trawieniu enzymami
Ligacja lepkich/tepych koncow jest wydajniejsza?
begynn å lære
Lepkich, bo pomiedzy komplementarnymi 1-nicowymi fragmentami lepkich k. tworza sie wiazania wodorowe, co ulatwiaja ligacje
Fragmenty DNA powstałe po cięciu okreslonym enzymem moga bzostac polaczone z innym DNA
begynn å lære
wektorem, trawionym tym samym enzymem
Końce DNA badanego i DNA wektora
begynn å lære
są sparowane komplementarnymi nukleotydami i mogą być łączone za pomocą ligazy
Wbudowany fragment DNA to
begynn å lære
wstawka
Wektory autonomiczne
begynn å lære
replikują się niezależnie od genomu gospodarza
Wektory integracyjne
begynn å lære
włączają się do DNA gospodarza i są bardziej stabilne, ale występuja w mniejszej liczbie kopii
Wektory retrowirusowe mogą spowodobac
begynn å lære
Wektory retrowirusowe mogą spowodobacintegracje sekwencji przenoszonej w wektorze z genomem gospodarza
Wektory ekspresyjne
begynn å lære
zapewniają wydajną ekspresję klonowanej sekwencji
Wektory bifunkcjonalne
begynn å lære
mogą występować w co najmniej 2 różnych organizmach, przy czym istnieje możliwoc przeniesienia wektora z komorki prokariotycznej do eu. i vice versa
Najwazniejszym elementem warunkujacym efektywnosc wektora sa
begynn å lære
sekwencje ori, odpowiedzailne za rozpoczęcie replikacji
Jeśli wektor za wstawka bedzie namnazy w kom. bakterii lub drozdzy to musi...
begynn å lære
posiadac sekwencję ori obydwu organizmów
Miejsca cięcia dla enzymów restrykcyjnych powinny znajdować się
begynn å lære
w obrębie markerów selkcyjnych MCS, co umożliwia identyfikację komórek, do ktorych wniknal zrekombinowany wektor
Plazmid to
begynn å lære
pozachromosomowa, zwykle kolista cz. DNA, wielkosc od kilku do kilkuset t. pz, zdolna do samodzielnej replikacji
Wielkosc wstawki, plazmid
begynn å lære
15 kpz
wielkosc wstawki, wektory fagowe
begynn å lære
ok 25 kpz
wielkosc wstawki kosmidy
begynn å lære
45 kpz
wielkosc wstawki PAC
begynn å lære
150 kpz
wielkosc wstawki BAC
begynn å lære
500 kpz
wielkosc wstawki YAC
begynn å lære
1 000 kpz
Bakteriofagi
begynn å lære
wirusy infekujące bakterie przez wstrzykniecie swojego DNA do wnetrza kom, bakteryjnej, stosowane jako wektory
W budowie bakteriofagów rozroznia sie
begynn å lære
dwuniciowy dna lub rna otoczony białkiem kapsydu
fag λ
begynn å lære
48 kpz, infekuje E. coli, wstrzykuje 2niciowy liniowy DNA do komórki, w ktorej przeksztalca sie w forme kolistą(umożliwiają to sekwencje cos znajdujace sie na koncach liniowego DNA faga)
Wektory typu replacement ("z zastąpieniem")
begynn å lære
rodzaj wektora lambda, gdy region genomu faga podlega wymianie na obce DNA
wektory typu insercyjnego
begynn å lære
wektory rodzaj lambda, gdzie wbudowywany fragment obcego dna zawiera się w granicach do 8 kpz
pochodnymi faga λ są
begynn å lære
charony, centralna cz. bakteriofaga λ ktora nie jest niezbedna moze byc usunieta i zastapiona obcym DNA
Pochodne faga M13 charakteryzuje
begynn å lære
szczególny cykl zyciowy, pozwalajacy na wykorzystanie go do wytwarzania jednonicowego DNA
M13
begynn å lære
fag podłużny, nitkowaty, 6400pz, nie powoduje lizy, lecz jest uwalniany z zyjacych kom. bakteryjnych
Po wstrzyknieciu DNA faga m13 do komorek bakteryjnych
begynn å lære
syntetyzowana jest druga nic DNA
Kosmid budowa
begynn å lære
skladaja sie z sekwencji plazmidu bakteryjnego z genem ori, polaczonych z sekwencją cos faga λ, ktora jest konieczna do pakowania DNA do wnętrza kapsydów fagowych
Kosmid infekuje
begynn å lære
komórki bakteryjne podobnie jak fag λ, a jego DNA replikuje jak DNA plazmidu
Pac
begynn å lære
Rozbudowana wersja kosmidu, sztuczny chromosom wyprowadzony z faga p1, o wielkosci 19,5 kpz
YAC
begynn å lære
sztuczne chromosomy drozdzy, CEN4 , TEL, ARS zostały wyizolowane i polaczone z plazmidami skonstruowanymi dla E. coli
CEN4
begynn å lære
Sewkencje drozdzowe centromeru
TEL
begynn å lære
sekwencje drozdzowe telomeru
ARS
begynn å lære
miejsca poczatku replikacji
BAC
begynn å lære
zrekombinowane DNA bazujace na DNA plazmidu F bakterii E. coli
BAC i YAC służą do
begynn å lære
lokalizacji nowych genów i poszukiwania nowych sond DNA
Wektorami używanymi do klonowania w komorkach ssakow sa
begynn å lære
wektory eukariotyczne oparte na wirusach.
Transformacja
begynn å lære
wbudowania zrekombinowanego wektora do komórki gospodarza
komórki kompetentne
begynn å lære
odpowiednio przygotowane na przyjęcie DNA
Elektroporacja
begynn å lære
silny impuls elektryczny powodujacy przejsciowe utworzenie w bl. kom. mikroporów, przez ktore moze przenikac zrekombinowany DNA
Po transformacji bakterie wysiewa się na
begynn å lære
odpowiednie podłoże selekcyjne. Selekcja opiera się na obecności w wektroze genów markerowych
geny markerowe w wektorze nadaja
begynn å lære
transformantom określony fenotyp
Selekcja po transformacji, bakterie
begynn å lære
1) umiejscowanie w plazmidzie 2 genów odporności, 2) test alfa-kompetencji
Umiejscowowienie w plazmidzie 2 genów odporności
begynn å lære
kazdy z genow odpowiada za opornosc na inny antybiotyk, przy czym 1 z nich ma fragment do klonowania. Komorka, ktora plazmidu nie pobrala bedzie wrazliwa na oba antybiotyki.
Test alfa-komplementacji
begynn å lære
Bakterie ktore pobrały zrekombinowy plazmid, kolor bialy. Bakterie gdzie komplemetnacja mutacji, niebieskie
Polilinkery wektorow sa umiejscowione
begynn å lære
w obrebie genu kodujacego enzym B-galaktozydaze.
Dzięki bibliotece cDNA można uzyskac infromacje
begynn å lære
o genach aktywnych w danym typie komórek lub tkanek
PCR odzwierciedla
begynn å lære
naturalny proces replikacji i umożliwia powielenie wyhbranych odcinków kwasów nukleinowych
Sposoby usuwania białek (odbiałczania) preparatu
begynn å lære
1) z zastosowaniem fenolu i chloroformu, wskutek wysolenia białek z lizatów komórek, po związaniu DNA z nośnikiem
Sposoby usuwanie białka: po związaniu DNA z nośnikiem
begynn å lære
Używane są kolumny chromatograficzne z filtrami jonowymiennymi lub krzemionkowymi
320nm
begynn å lære
tło i możliwe kontaminacje
Elektroforeza preparatywna umożliwia
begynn å lære
izolację z żelu tej cz. preparatu, która jest niezbędna do dalszych prac. Do tego celu stosuje się różne techniki elucji
Elektroforeza analityczna słuzy do
begynn å lære
charakterystyki badanego preparatu na danym etapie dośiwadczenia.
Rozkład frakcji rybosomalnych moze byc wykorzystywany jako
begynn å lære
orientacyjny marker mas czasteczkowych, gdyzy znane sa wielkosci podstawowych frakcji
Wielkość 18s
begynn å lære
1,9 kpz
wielkość 28s
begynn å lære
5,0 kpz
Bromek etydyny, co robi
begynn å lære
interkaluje pomiędzy pary zasad, powodujac intensywną fluorescencję w świetle UV
Barwienie bromkiem etydyny umożliwia wizualiację DNA w ilości
begynn å lære
10 ng w pojedynczym brążku
Kompleks SYBr-dna ma maksiumum absorpcji... maksiumum emisji
begynn å lære
Absorpcji: dlugosc fali 498nm(niebieski), emisji: 522nm (zielony)
Do rozdzielenia duzych czasteczek DNA, od 20 kpz do 10 mpz stosuje sie
begynn å lære
elektroforezę w polu pulsacyjnym
Elektroforeza w polu pulsacyjnym
begynn å lære
Pole elektryczne jest włączane i wyłączane w krotkich odstepach czasu, zmieniajac kierunek pola elektrycznego o 90 lub 180.
Elektroforeza kapilarna służy do
begynn å lære
rozdziału niewielkich czasteczek kwasow nukleinowych; zwana inaczej elektroforezą w wolnym buforze
Podstawowe techniki wykorzystujace rozdzial w kapilarach objete sa
begynn å lære
ogolnym pojeciem wyskosprawnej elektroforezy kapilarnej HPCE
Elektroforetyczne przenoszenie (elektotransfer)
begynn å lære
Przenoszenie cz. kwasów nukleinowych rozdzielonych uprzednio w żelu na wiazace je nosniki
Podczas zwyklej elektroforezy prad plynie
begynn å lære
wzdłuż łaszczyzny żelu, przyczynaiajc sie do rozdzialu czas.
W transferze elektroforetycznym prąd płynie
begynn å lære
przez całą grubość żelu przyczyniając się do efektywnego przeniesienia cz. z żelu na bibułę lub różne rodzaje membran nałożonych n ażel.
Transfer na membrany można przeprowadzić z wykorzystaniem
begynn å lære
sił kapilarnych
Hybrydyzacja to
begynn å lære
tworzenie podwójnej helisy między komplementarnymi niciami DNA lub RNA pochadzącymi z różnych źródeł. Dna najczęściej bada się w postaci fragmentów pojedyczych nici.
Sonda molekularna
begynn å lære
Druga część powstającej hybrydy znajdujaca sie w roztworze hybrydyzacyjnym
Sondami molekularnymi moga byc
begynn å lære
fragmenty 1-niciowego dna/rna/cdna, syntetyczny oligonukleotyd, sonda utworzona dzieki amplifikacji PCR
Sondy można znakować
begynn å lære
radioaktywnie, nieradioaktywnie, immunochemicznie, enzymatycznie
Wykrycie sygnały sondy po hybrydyzacji jest możliwe
begynn å lære
dzięki jej znakowaniu.
Znakowanie sondy: radioaktywnie
begynn å lære
do sondy włączany jest nukleotyd znakowany radioaktywnym izotpoem, detekcja opiera się na naświetlaniu klisz wrażliwych na promieniowanie w procesie autoradiografii
Znakowanie sondy: nieradioaktywnie
begynn å lære
np. metodami fluorescencyjnmi, za pomocą emisji swiatla o okreslonej dlugosci fali i roznego typu fluorochromów
Znakowanie sondy: immunochemicznie
begynn å lære
do sondy włącza sięnukleotyd sprzężony z haptenem(biotyna, digoksygenina, fluoresceina)
Znakowanie sondy: enzymatycznie
begynn å lære
do sondy włączany jest nukleotyd sprzezony z czasteczka enzymu
Hybrydyzacja in situ wykorzystywana
begynn å lære
do rozmazów komkórkowych lub skrawków tkanek po ich odpowiednim przygotowaniu celem odsłonięcia i denatruacji kwasów nukleinowych, a tym samym uzyskania mozliwosci laczenia sie ich nici z sek. komp. sondy
Dot blot
begynn å lære
Odmiana Southern, pozwala na jednoczesne wykrywanie i identyfikację wielu probek DNA na tym samym filtrze
Slot blot
begynn å lære
zamiast nakrapiania na membranę, stosuje się specjalnie przygotawny wzorzec szczelin, do ktorych nanosi sie DNA
slot blot może byc wykorzystywana
begynn å lære
jako analiza ilościowa przy założeniu wprowadzenia przed hybrydyzacją wzorców ilości użytego DNA
Hybrydyzacja kolonijna
begynn å lære
na membranie umieszcza się kolonie bakteryjne zawierające poszczególne klony. Po transformacji komórek bakteryjnych zmodyfikowanym plazmidem i wysianiu na szalki Petriego replikuje się kolonie na filtr.
Co po replikowaniu koloni na filtr? hybrydyzacja kolonijna
begynn å lære
poddaje się hybrydyzacji i autoradiogrofii
Hybrydyzacja łysinkowa
begynn å lære
Po transformacji komórek bakteryjnych wektorem fagowym i wysianiu ich na szalki petriego replikuje się na kolonie na filtr.
Co po przeniesieniu koloni na filtr? hyb. łysinkowa
begynn å lære
Przytwierdza się przeniesione fagi do filtru i hybrydyzuje z sondą, a nastepnie poddaje autoradiografii.
Makromacierze, działanie
begynn å lære
naniesienie na nosnik licznych wzorcowych sekwencji bedacych podłożem do hybrydyzacji materiału badanego.
Mikromacierze ekspresyjne zawierają
begynn å lære
11-20 sond oligonukleotydowych obejmujących fragmenty 3' kazdego ze znanych transkryptow danego organizmu
Mikromacierze eksonowe zawierają
begynn å lære
sondy homologiczne dla poszczególnych eksonów danego transkryptu
Mikromacierze dachówkowe (równomiernie pokrywające genom) umożliwiają
begynn å lære
identyfikację miejsc wiązania sie czyn. transkrypcyjnych, modyfikacji histonow, metylacji Dna i inne zwiazane z reg. transkrypcji.
Chip-chip pozwala na
begynn å lære
jak czesto i w jakich miejscach genomu wiązane są konkretne białka, co stwarza mozliwosc stowoistego mapowania interakcji bialko-DNA.
PRINS
begynn å lære
synteza in situ przy udziale startera.
Princs, jak działa
begynn å lære
Hybrydyzacja nieznakowana sondą z wykrywaniym od. kwasu nuklei., a nastepnie wprowadza się polimerazę DNA i znakowane nukleotydy.
Diagnostyka preimplantacyjna blastomerów uzyskanych drogą biopsji zarodka, co się uzywa, jakich metod?
begynn å lære
PRINCS i pcr
Mikromacierze wykorzystywane do:
begynn å lære
analizy trasnkryptomicznej(RNA), badania: DNA, sekwencji genów, oddziaływania DNA z białkami, modyfkiacja chromatyny chip-chip, analiza SNP
CGH nie!!! może służyć do
begynn å lære
wykrywania aberracji zrównoważonych (tylko niezrównoważone)
mikromacierz CGH (array CGH), czym sie rozni od CGH?
begynn å lære
Zastąpiono chromosomy metafazowe oligonukleotydami lub grafmentami DNA(jak bac/pac)
CGH mechanizm działania
begynn å lære
na szkiełku utrawala prawidłowo dzielące się komórki, z kom. badanych izoluje się DNA, to DNA hybrydyzuje się w mieszaninie z DNA kontrolnym 1:1
W technice RT-PCR reakcję poprzedza
begynn å lære
przepisanie sekwencji zawartej wyłącznie w dojzałym mRNA, a wiec powstalym tylko na bazie eksonow, na cDNA.
EST
begynn å lære
znaczniki ekspresji; kopiujac mRNA uzyskuje sie kilkusetnukleotydowe fragmenty DNA, z ktorej mRNA byl transkrybowane
EST reprezentują
begynn å lære
znaną, unikatową sekwencję klonu cDNa
IVTT = PTT
begynn å lære
test syntezy białka in vitro, służy do badania produktu reakcji RT-PCR
RAPD-PCR
begynn å lære
technika losowej amplifikacji polimorficznego DNA
RAPDpPCR umożliwia
begynn å lære
równoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
w LCR stosuje się
begynn å lære
powielanie in vitro fragmentu kwasu nukleinowego w wyniku wielokrotnego powtórzenia reakcji ligacji 2 oligonukleotydów
Metoda LCR pozwala na
begynn å lære
analizę mutacji genów
Różnica między PCR a LCR
begynn å lære
zastosowanie w LCR 4, a nie 2 starterów + posiada termostabilną ligazę
MLPA
begynn å lære
Reakcja łańcuchowej polimerazy, pozwalającą na względnie równoczesną i ilościową ocenę do czterdziestu sekwencji nukleotydowych.
HRM
begynn å lære
analiza krzywych topnienia DNA. Jeśli mutacje, krzywa topnienia ma nieco inny przebieg niz prawidłowa.
W MLPA amplifikacji ulega
begynn å lære
sondy, które podlegają hybrydyzacji z badanym fragmentem DNA, a nastepnie ligacji.
MLPA- po ligacji
begynn å lære
powstają matryce do reakcji multipleks PCR. W przypadku delecji 1 z alleli uzyskuje się o 1/2 mniejszą ilośćmatrycy.
MLPA - 1 sonda każdej pary zawiera
begynn å lære
między sekwencją komplementarną do badanego DNA dodatkową sekwencję, tzw. łącznik
MLPA - w każdej z poszzcególnych par sond, sekwencja łącznika...
begynn å lære
ma różna, zdefiniowaną długość, co umożliwia w czasia rozdział elektroforetyczny i identyfikację fragmentów na podstawie ich długości.
GAP-LCR
begynn å lære
odmiana LCR, gdzie stosuje się jednoczesnie ligazę i polimerazę DNA
w reackji GAP-LCR między oligonukleotydami hybrydyzujacymi z dna powstaje
begynn å lære
przerwa, ktora zostaje uzupelniona przy udziale polimerazy DNA.
PCR-SSCP
begynn å lære
Analiza polimorfizmu konformacji pojedynczej nici. Obie nici poddaje się denaturacji.
PCR-DGGE
begynn å lære
Zamiast denaturacji przed rozdziałem elektroforetycznym badanej cz. DNA mozna zastosowac czynnik denaturujacy zawarty bezposrednio w zelu
PCR-TGGE
begynn å lære
Zamiast denaturacji przed rozdziałem elektroforetycznym badanej cz. DNA gradient temperatury jako cz. denaturujacy
HA
begynn å lære
analiza heterodupleksów
CMC
begynn å lære
chemiczne rozszczepianie niesparowań heterodupleksów
Odmianą HA jest
begynn å lære
denaturująca wysokosprawna chromatografia cieczowa DHPLC
DHPLC wykorzystuje
begynn å lære
wysoka rozdzielczosc nowoczesnych wyplenien kolumn chromatograficznych, czulosc siega 100%
pirosekwencjonowanie
begynn å lære
na kazdym etapie syntezy dna jest inkubowane w obecnosci: polimerazy DNA, sulfurylazy ATP, luferyrazy i apyrazy
Sekwencjonowanie 454
begynn å lære
wykorzystywanie równoległego pirosekwencjonowania wielu fragmentów DNA w tym samym czasie.
SMRT
begynn å lære
Wykorzystuje pojedyn.cz. polimerazy DNA w trybie ciągłym.
Marker
begynn å lære
wyznacznik, dowolna, genetycznie kontrolowana cecha fenotypowa
Marker genetyczny
begynn å lære
każdy określony fragment DNA, białko, lub fenotyp
Mapa genomu
begynn å lære
oparta na częst. rekombinacji i analizy sprzezen
Markery molekularne(dna)
begynn å lære
mapowanie cech sekwencji nie będących sekwencjami genów
Markery genetyczne i molekularne nalezy odróżnic od =/=
begynn å lære
wzorcow masowych DNA podczas elektroforezy i od chromosomow markerowych
Jak nie mozna nazwac chromosomow markerowych?
begynn å lære
Markery, nie wolno!!!
Markery molekularne związane z niekodującym DNA dzieli się na
begynn å lære
polimorfizm sekwencji 1) anonimowych, 2) mini i mikro satelitarnych
DNA fingerprinting
begynn å lære
Badanie sekwencji repetytywnych niezbędnych do celów kryminalistycznych
Fingerprinting przez amplifikację DNA - DAF polega na
begynn å lære
amplifikacji DNA z użyciem 8-10 nukleotydowych starterów i następnie rozdziale produktów reakcji PCR w denaturujacym żelu poliakrylamidowym
Każdy SSLP może mieć
begynn å lære
wiele różnych wariantów długości, co oznacza wieloallelowośćw odróżnieniu od RFLP
SSLP
begynn å lære
szeregi powtórzen sekwencji o roznej dl. zawierajacych rozna liczbe jednostek powtarzalnych
Typy SSLP
begynn å lære
VNTR i STR
VNTR jednostka powtarzalna ma
begynn å lære
kilkadziesiat nukleotydów (10-100 bp)
Technikę VNTR najczęściej stosuje się w technikach...
begynn å lære
ustalenia ojcostwa.
Allele mikrosatelitów są
begynn å lære
kodominujące i dziedziczone w sposób mendlowski.
Typowe loci mikrosatelitarne zawierają
begynn å lære
10-30 (maksymalnie 50) powtórzen motywu i osiagaja długosc 100 do 400 bp.
VNTR, jednostka powtarzalna ma
begynn å lære
klikladziesiąt nukleotydów (10-100bp)
TechnikaVNTR zostałą wyparta przez
begynn å lære
analizę polimorfizmu krótkich powtórzen tandemowych STR
STR stosuje sie przy badaniu
begynn å lære
powtórzen tandemowych (tg)n i (ca)n
Typowie loci mikrosatelitarne zawierają
begynn å lære
10-30 powtórzen motywu i długosc 100 do 400 bp
Najszybszym sposobem oznaczania polimorfizmów dł. mikrosatelitarnych jest
begynn å lære
Reakcja PCR
SSR
begynn å lære
obejmuje analize DNA mikrosatelitarnego, obecnego we wszystkich genomach różnych organzimów
SAMPL
begynn å lære
Połączenie AFLP i SSR. Amplifikowane odcinki DNA znajdujace się miedzy miejscem rozpoznawanym przez enzym res. a sekwencją mikrosatelitarną.
RFLP
begynn å lære
Marker, polimorfizm dł. fragm. restrykcyjnych, char. wariant określonego genu
RAPD
begynn å lære
marker, losowo amplifikowany polimor. DNA, char. genom
AFLP
begynn å lære
marker, polimorfizm dł. amplifikowanego fr., charakteryzuje genom
SAMPL
begynn å lære
selektywnie amplifikowany polimorfizm loci miikrosat.
SAMP wypiera
begynn å lære
klasyczny AFLP ponieważ generuje prążki o bardzo wys. polimorfizmie i umożliwia wykrycie alleli kodomnujących
SNP
begynn å lære
polimorfizm poj. nukleotydu, charakteryzuje wariant określonego genu lub polimorfizm sek. niekodującej
STS
begynn å lære
miejsce znaczone sekwencyjnie; identyfikacja chromosomow lub ich regionów
SSR
begynn å lære
amplifikowane sekwencje mikrosat, analiza genotypów
W technice PCR powiela się
begynn å lære
wybrany fragment DNA

Du må logge inn for å legge inn en kommentar.