Biochemia egzamin

Struktura 1-rzędowa

To sekwencja aminokwasów, ich kolejność, liniowe ułożone determinowane przez kolejność nukleotydów w DNA

Struktura 2-rzędowa

Zwinięcie struktury pierwszorzędowej utrwalone za pomocą wiązań wodorowych: Alfa helisa, Beta harmonijka

Alfa helisa

Spiralna struktura prawoskrętna drugorzędowa białka, stabilizowana przez wiązania wodorowe

Beta harmonijka

jedna z struktur drugorzędowych białka (obok m.in. helisy alfa). Ten sposób przestrzennego ułożenia aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym

Struktura 3-rzędowa

Struktura warunkująca właściwości białka, stabilizowana przez wiązania powstające pomiędzy oddalonymi aminokwasami

Struktura 4-rzędowa

To sposób połączenia się struktur 3-rzędowych, gdy białko zbudowane jest z więcej niż jednego łańcucha peptydowego

Fosforylacja

Przyłączenie grupy fosforanowej (PO₄³⁻) do reszt seryny, treoniny lub tyrozyny

Glikozylacja

Przyłączenie cukrów do bocznych łańcuchów aminokwasowych (np. asparagina, seryna).

Enzym

to białka o właściwościach katalitycznych, które przyspieszają reakcje chemiczne w organizmie

Cechy miejsc aktywnych enzymów

To specjalnie ukształtowany obszar na powierzchni enzymu, w którym następuje wiązanie substratu

Zymogen

To biologicznie nieaktywna forma enzymu, która staje się aktywna po przetworzeniu (np. poprzez hydrolyzę pewnych fragmentów białkowych)

Glukoneogeneza

To metaboliczna ścieżka, która umożliwia organizmowi syntezowanie glukozy z nieglukowych precursorsów

Łańcuch oddechowy

To proces zachodzący na wewnętrznej błonie mitochondriów, elektrony przekazywane przez szeregi białek i koenzymów, tworzą gradient protonowy

Punkt izoelektryczny białka

Białko ma zerową ładunek elektryczny, tzn. liczba jonów dodatnich równa się liczbie jonów ujemnych

Witaminy

to organiczne związki niezbędne do prawidłowego funkcjonowania organizmu, Są kluczowe dla procesów metabolicznych, działania enzymów i utrzymania homeostazy.

Glikoliza

Zachodzi w cytoplazmie wszystkich komórek organizmu. Celem jest dostarczenie energii w postaci ATP do procesów metabolicznych

Cykl Krebsa

Szereg reakcji chemicznych kluczowych dla oddychania komórkowego. Zachodzi w macierzy mitochondrialnej. Utlenia acetylo-CoA do dwutlenku węgla. Produkuje NADH i FADH2, które przekazują elektrony do łańcucha oddechowego, gdzie powstaje ATP.

Fosforylacja oksydacyjna

To główny proces syntezy ATP w mitochondriach, który wymaga obecności tlenu i wykorzystuje energię z gradientu protonowego.

Fosforylacja substratowa

To prostszy proces, który nie wymaga tlenu i polega na bezpośrednim przeniesieniu energii z wysokoenergetycznych związków na ADP

Przemiany pirogronianu

Warunki tlenowe: Wprowadzenie pirogronianu do cyklu Krebsa w celu pełnego utlenienia do CO₂ i produkcji energii, Warunki beztlenowe: Regeneracja NAD⁺ w celu umożliwienia kontynuacji glikolizy w braku tlenu

Glukoneogeneza

Synteza glukozy z prekursorów nie będących węglowodanami (np. aminokwasów, mleczanu).

Model Michaelisa-Menten

opisuje kinetykę reakcji enzymatycznych w warunkach stanu ustalonego

Model Lineweavera-Burka

to linearyzacja równania Michaelisa-Menten, otrzymana przez wzięcie odwrotności obu stron równania. Umożliwia łatwiejsze określenie parametrów kinetycznych z danych eksperymentalnych.