→ Wejściówka 2 → Start læring / Last ned MP3 Flashcards

spørsmålet		svaret
Ludzie hetero-czy mono zygotami i jak długi jest ich łańcuch genowy begynn å lære		są heterozygotami oraz mają dłigośc 1/500 pz
SNP begynn å lære		single nucleotide polymorphism
CNV begynn å lære		copy number variation
HGP begynn å lære		human genome project
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego genu begynn å lære		knockout genowy
genomika porównawcza begynn å lære		porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika begynn å lære		wiedza o zespołach białek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika begynn å lære		badania regulacji ekspresji genów na poziomie transkrypcji
Rekombinacja DNA in vitro jest możliwa dzięki? begynn å lære		enzymom restrykcyjnym Endonukleazy
Gdzie znaleziono Endonukleazy? begynn å lære		Znalezione jedynie w komórkach bakterii i sinic
Czemu zapobiegają Endonukleazy u bakterii i sinic? begynn å lære		Zapobiegają włączenie obcego DNA do genomu bakterii
Jaką długość ma sekwencja zwykle rozpoznawana przez Endonukleaze? begynn å lære		specyficzna sekwencja dwuniciowego DNA ma zwykle długość 4-8 par zasad
Aktywność „star” Endonukleaz co oznacza? begynn å lære		Oznacza to ze trzeba zwrócić uwagę na warunki oznaczone przez producenta gdyż b uzyskać oczekiwany efekt trzeba przeprowadzić reakcje w warunkach podanych przez producenta
w jakiej długości światła są wykrywane zasady aromatyczne begynn å lære		światło o długości 260 nm
w jakiej długości światła są wykrywane Białka begynn å lære		światło o długości 280 nm
Od czego zależy współczynnik ekstrakcji begynn å lære		od długości badanej cząsteczki
Absorpcja największa jest dla czego a najmniejsza dla czego begynn å lære		Absorpcja największa dla nukleotydów a najmniejsza dla dsDNA
Hipochromizm begynn å lære		Mniej barw
DsDNA o stęż 1mg/ml - A260 begynn å lære		20
RNA i ssDNA - A260 begynn å lære		25
Co ma wyższy współczynnik ekstrakcji puryny czy pirymidyny begynn å lære		Puryny mają wyższy współczynnik ekstrakcji niż pirymidyny
Co powoduje topnienie (ogrzewanie) begynn å lære		40% wzrost absorbancji
Co powoduje szybkie ochładzanie? begynn å lære		minimalny spadek absorbancji
Co powoduje wolne ochładzanie? begynn å lære		absorbancja bez zmian
Co daje Wektor begynn å lære		zdolność do izolacji od gospodarza i replikacji
Co daje wektor Fag λ begynn å lære		klonowania większych fragmentów
Co daje wektor H13 begynn å lære		klonowania fragmentów jednoniciowych
Co to kosmid begynn å lære		plazmid + fag λ
Episomalne plazmidy begynn å lære		wektory dla drożdży
Plazmid Ti begynn å lære		dla roślin
Biblioteki DNA begynn å lære		zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne begynn å lære		analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne begynn å lære		czyli takie, które są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+ i Rb2+
Transformanty begynn å lære		przechowywane są najpierw w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja) a następnie zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy) → tzw. zapas glicerolowi
Co pozwala odnaleźć polarność klonów cDNA begynn å lære		Rejon kodujący
W czym są umieszczone polarne startery? begynn å lære		Są umieszczone w postaci oligo(dT)
Polarne startery są komplementarne do? begynn å lære		poliA
W klonach genomowych jakie mamy geny? begynn å lære		Nie wiadomo od razu gdyż obecność genów nie jest oczywista
W klonowany genomach wiemy o jego polarności? begynn å lære		Nie za bardzo gdyż polarność nie jest oczywista w klonowanych genach
Hybrydyzacja i mapowanie pozwana nam określić? begynn å lære		Organizowanie klonowanych genów
na podstawie czego przygotowuje się Sondy begynn å lære		na podstawie Southerna części sekwencji cDNA
Co można wykazać na podstawie Sondy przygotowanej metodą Southerna? begynn å lære		Można określić która część klonu genomowego zawiera sekwencje komplementarne do sond.
Mapowanie za pomocą nukleazy S1: begynn å lære		Identyfikacja końca 3’/5’ - hybrydyzacja transkryptu z dłuższym antysensownym fragmentem na jednym końcu Usuwanie fragmentów jednoniciowych - poddanie hybryd działaniu nukleazy S1 Określanie wielkości pozostałych dwuniciowych fragmentów - elektroforeza
Wydłużanie startera begynn å lære		Starter jest wydłużany przez polimerazę dopóki nie osiągnie końca matrycy Następnie dochodzi do oddysocjowania polimerazy Długość wydłużonego fragmentu wskazuje na koniec 5’ matrycy
Retardacja żelowa begynn å lære		Zmieszanie ekstraktu białkowego ze znakowanym fragmentem DNA Rozdział mieszaniny w niedenaturującym żelu poliakryloamidowym Ujawniają się kompleksy DNA-białko w postaci prążków retardacyjnych (opóźnionych)
Technika „odcisku stopy” z udziałem DNazy I begynn å lære		„Odcisk stopy” białka związanego specyficznie z sekwencją DNA Może zostać ujawniony poprzez działanie małą ilością DNazy I na mieszaninę DNA i białka poddaje się analizie elektroforetycznej
Geny reporterowe begynn å lære		Łatwo wykrywalne geny,
W jakim celu przyłącza się geny reporterowe? begynn å lære		W celu zidentyfikowania funkcji jakiegoś promotora
Po przyłączeniu geny reporterowego co się bada begynn å lære		Bada się ilość powstałego produktu białkowego
Jak określimy ważność poszczególnych sekwencji? begynn å lære		poprzez dokonywanie progresywnych delecji DNA z jednego końca
Co pozwala uzyskać jednokierunkowe delecje? begynn å lære		Egzonukleaza III - Usuwa kolejne nukleotydy w kierunku 3’→5’, gdzie koniec 3’ w dwuniciowy DNA jest cofnięty w stosunku do 5’
łączenie fragmentów sekwencji begynn å lære		Powstałe cząsteczki poddaje się ligacji
Mutageneza ukierunkowana? begynn å lære		Uzyskiwanie zmian jednego lub kilku nukleotydów w określonym miejscu sekwencji
Jak przeprowadza się mutagenezę begynn å lære		W tym celu wykorzystuje się przyłączanie mutagennego startera i syntezę komplementarnego DNA z użyciem polimerazy DNA
Mutageneza dawniej begynn å lære		Dawniej - jednoniciowe matryce przygotowane z użyciem wektorów M13
Mutageneza obecnie begynn å lære		Obecnie - matryce otrzymane metodą PCR
Cel mutagenezy metodą PCR begynn å lære		amplifikacja fragmentów DNA od strony 5’ lub 3’
Zastosowanie klonowania begynn å lære		Wytwarzanie: zrekombinowanego białka, GMO, „odcisku DNA”, przygotowywanie zestawów diagnostycznych, terapie genowe
Jak powstaje zrekombinowane białko begynn å lære		może być produkowane dzięki wprowadzeniu genu rzadko występującego białka do plazmidu i poddanie ekspresji w bakteriach, gdy krytycznym etapem jest modyfikacja potranslacyjna, gen może być poddany ekspresji w kom. eukariotycznych
Jak powstaje GMO begynn å lære		powstaje poprzez wprowadzenie obcy gen do komórki, z której można zregenerować cały organizm
Jak powstaje „Odcisk DNA” begynn å lære		hybrydyzacja, przeniesionego metodą Southerna, genomowego DNA z sądami, które rozpoznają proste powtórzenia nukleotydów prowadzi to do otrzymania obrazu, który jest unikatowy dla danego osobnika i może być stosowany do jego identyfikacji.
Terapia genowa - próby skorygowania genetycznych zaburzeń przez wprowadzenie do organizmu pacjenta prawidłowej kopii genu begynn å lære		próby skorygowania genetycznych zaburzeń przez wprowadzenie do organizmu pacjenta prawidłowej kopii genu
Czystość DNA begynn å lære		A260/A280 = 1,8 -czyste DNA A260/A280 < 1,8 -zanieczyszczone białkiem A260/A280 > 1,8 -zanieczyszczone RNA
Wirowanie izopikniczne begynn å lære		To inaczej równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia Wirowanie izopikniczne begynn å lære		Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Co z RNA i białkami podczas wirowania izopiknicznego? begynn å lære		RNA w dół, białka flotują = unoszą się
elektroforeza mikrokapilarna begynn å lære		z wykorzystaniem macierzy
elektroforeza kapilarna begynn å lære		w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, w cienkiej kapilarze kwarcowej
elektroforeza w żelu poliakrydynowym begynn å lære		5-1000 pz (gRTPCR)
elektroforeza W żelu agarozowym begynn å lære		0,1 -20 kpz
elektroforeza W polu pulsacyjnym begynn å lære		20kpz - 10 Mpz (oddziela cząsteczki wielkości 100 kpz!)
Choroba Takahary = alaktazemia begynn å lære		Gen kontrolujący syntezę katalazy - krótkie ramię chromosomu 11 - 11p13
Mechanizm Choroba Takahary = alaktazemia begynn å lære		redukuje aktywność katalazy
objawy Choroba Takahary = alaktazemia begynn å lære		Owrzodzenia śluzówek jamy ustnej, podudzi oraz wczesne wypadanie zębów
gdzie najczęsciej występuje Choroba Takahary = alaktazemia begynn å lære		Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Dziedziczenie Choroba Takahary = alaktazemia begynn å lære		autosomalnie recysywnie
Wrażliwość na chlorek suksametonium - begynn å lære		zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale tez szybko znika(za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialnej za objawy odpowiada cholinoesteraza- jej gen na 3 chromosomie i tam mutacja)
Hipertermia złośliwa begynn å lære		przez leki znieczulenia ogólnego: antyestetyki, zwioty, glikozydy naparstnicy. Wzrasta napięcie mięśni prążkowanych, drżenie mięśniowe, tachykardia, wzrost temp. ciała (1C w ciągu 5 min) Mutacja 19q13.1
Alaktazemia begynn å lære		gen 11p13, autosomalna recesywna
Metabolizm alkoholu etylowego- 2 enzymy begynn å lære		dehydrogenaza alkoholowa ADH (chromosom 4) i dehydrogenaza aldehydowa ALDH (1-chromosom 9, 2-chromosom 12) Najczęściej u Azjatów
Porfirie begynn å lære		porfiryny to prekursory hemu i składniki enzymów: wątrobowe i erytropoetyczne. Deficyty enzymów biorących udział w przemianach porfiryn. OPP=> wątrobowe. Autosomalnie dominująco.
Krzywica oporna na wit D3 begynn å lære		gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenazy glukozo-6-fosforanowej begynn å lære		chromosom X
Niedobór alfa-1-antytrypsyny begynn å lære		gen PI, chromosom 14,
Niedobór paraoksonazy begynn å lære		gen PON1 na chromosomie 7 sprzężony z genem CFTR
Hemochromatoza begynn å lære		gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
Hipolaktazja begynn å lære		3 allele na chromosomie 3
Fenyloketonuria begynn å lære		autosomalnie recesywnie, 12q24.1
Co wywołuje ostrą porfirię? begynn å lære		Leki (barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanol), infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizyczny.
Formy enolowe/ketonowe begynn å lære		W pH obojętnym - ketonowa, w zasadowym - enolowa
Co to sonikacja? begynn å lære		Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA co prowadzi do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkości.
Podział zasad. begynn å lære		Puryny: adenina i guanina (2 piescienie) Pirymidyny: cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścień)
Liza alkaliczna (element minizolacji plazmidów) begynn å lære		Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosomowego DNA i innych
Plazmidy begynn å lære		Autonomiczne, pozachromosomowe elementy genetyczne W postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
PCR - łańcuchowa reakcja polimerazy begynn å lære		Do amplifikacji sekwencji DNA Z użyciem pary oligonukleotydowych starterów Każdy jest komplementarny do jednego końca docelowej sekwencji DNA Termostabilna polimeraza DNA powoduje wzajemne wydłużanie się ku sobie starterów
Etapy PCR begynn å lære		Etapy: denaturacja (95°C), przyłączenie startera (55°C), polimeryzacja (72°C) Elementy wymagane: matryca, startery, bufory, enzym, Mg2+, dNTP
Startery PCR begynn å lære		Startery: para oligonukleotydów o długości 18-30 pz i podobnej zawartości G+C
Enzymy PCR begynn å lære		termostabilna (odporna na denaturację) polimeraza DNA np. Taq

Wejściówka 2

Du må logge inn for å legge inn en kommentar.